热血传奇中的骷髅洞通常共有三层，正式地图名称为半兽古墓一层、半兽古墓二层和半兽古墓三层，玩家口中的骷髅洞一般就是这三张连续地图。进入一层后可以继续前往二层，二层再通往三层，最深处就是三层，不存在标准地图中的第四层。部分地图资料还会把相关区域显示为洞穴地图，但层级结构仍按一、二、三层区分。
前往三层时，最省时间的走法是先记住两个关键转场位置：一层进入后向右侧移动，优先让横坐标增加、纵坐标减少，接近332:117附近寻找二层入口；进入二层后继续向右推进，在380:66附近寻找三层入口。路线畅通时，从一层走到三层大约需要3至5分钟；如果坐标显示与实际地图不一致，应优先查看小地图上的传送点，不要在岔路口反复绕行。进入新层后先确认回程入口，再开始清怪，避免背包满载或药品不足时找不到出口。
一层适合刚进入骷髅洞、装备较差或需要熟悉路线的玩家，建议沿外围绕圈清理，遇到连续两次被围攻、生命值跌至一半以下时先退回入口附近。二层怪物种类和数量更丰富，适合已经能够稳定单挑普通骷髅的玩家，清怪时采用打一片、退几步、再回头的循环，比站在原地等待刷新更安全；二层还存在骷髅、骷髅战士、骷髅战将、掷斧骷髅、蝎子、洞蛆和山洞蝙蝠等怪物，背包至少预留三分之一空间装药水和装备。
三层适合有稳定输出、药品储备充足，或拥有队友配合的玩家，重点区域通常是桥附近和几个刷新密集点。单人进入时不要长时间固定蹲守一个位置，应在桥区与外围之间来回移动，既能保持击杀节奏，也能减少被刷新怪物包围的风险；组队时可由战士在前方聚怪，道士负责治疗和辅助，法师在后方集中清理，队伍人数以2至4人为宜。只想安全练级时选择一层或二层即可，需要更高刷新效率和更密集战斗时再进入三层，打完一轮后按药品余量和负重情况决定继续深入还是回城整理。